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SARS-CoV-2, le varianti.

SARS-CoV-2, le varianti.

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SARS-CoV-2 sta avendo ha avuto un impatto senza precedenti sulla salute umana a livello globale, infettando milioni di persone e causando conseguenze a lungo termine associate. Ora, l’OMS sta ricevendo diverse segnalazioni di eventi insoliti, probabilmente dovuti a varianti di SARS-CoV-2.

Redazione. (Fonte: OMS)

L’OMS valuta regolarmente se le varianti di SARS-CoV-2 comportano cambiamenti nella trasmissibilità, presentazione clinica e gravità, o se hanno un impatto sulle contromisure, inclusi diagnosi, terapie e vaccini. Precedenti segnalazioni della mutazione D614G e le recenti segnalazioni di varianti di virus dal Regno di Danimarca, Regno Unito di Gran Bretagna e Irlanda del Nord e Repubblica del Sud Africa hanno sollevato interesse e preoccupazione per l’impatto dei cambiamenti virali.

Una variante di SARS-CoV-2 con una sostituzione D614G nel gene che codifica per la proteina spike è emersa alla fine di gennaio o all’inizio di febbraio 2020. Per diversi mesi, la mutazione D614G ha sostituito il ceppo SARS-CoV-2 iniziale identificato in Cina ed entro giugno 2020 è diventata la forma dominante del virus che circola a livello globale. Studi su cellule respiratorie umane e su modelli animali hanno dimostrato che rispetto al ceppo virale iniziale, il ceppo con la sostituzione D614G ha aumentato l’infettività e la trasmissione. Il virus SARS-CoV-2 con la sostituzione D614G non causa malattie più gravi né altera l’efficacia della diagnostica di laboratorio, delle terapie, dei vaccini o delle misure preventive di salute pubblica esistenti.

Ad agosto e settembre 2020, nello Jutland settentrionale, in Danimarca, è stata identificata una variante SARS-CoV-2 legata all’infezione tra i visoni d’allevamento e successivamente trasmessa all’uomo. La variante, denominata variante “Cluster 5” dalle autorità danesi, presenta una combinazione di mutazioni non osservate in precedenza. A causa di studi preliminari condotti in Danimarca, si teme che questa variante possa portare a una ridotta neutralizzazione del virus negli esseri umani, che potrebbe potenzialmente ridurre l’estensione e la durata della protezione immunitaria a seguito di infezione naturale o vaccinazione. Sono in corso studi per valutare la neutralizzazione del virus tra gli esseri umani con questa variante. Ad oggi, a seguito di indagini e sorveglianza approfondite, le autorità danesi hanno identificato solo 12 casi umani della variante Cluster 5 nel settembre 2020 e non sembra essersi diffusa ampiamente.

Ad agosto e settembre 2020, nello Jutland settentrionale, in Danimarca, è stata identificata una variante SARS-CoV-2 legata all’infezione tra i visoni d’allevamento e successivamente trasmessa all’uomo. La variante, denominata variante “Cluster 5” dalle autorità danesi, presenta una combinazione di mutazioni non osservate in precedenza. A causa di studi preliminari condotti in Danimarca, si teme che questa variante possa portare a una ridotta neutralizzazione del virus negli esseri umani, che potrebbe potenzialmente ridurre l’estensione e la durata della protezione immunitaria a seguito di infezione naturale o vaccinazione. Sono in corso studi per valutare la neutralizzazione del virus tra gli esseri umani con questa variante. Ad oggi, a seguito di indagini e sorveglianza approfondite, le autorità danesi hanno identificato solo 12 casi umani della variante Cluster 5 nel settembre 2020 e non sembra essersi diffusa ampiamente.

Il 14 dicembre 2020, le autorità del Regno Unito hanno segnalato all’OMS una variante indicata dal Regno Unito come SARS-CoV-2 VOC 202012/01 (Variant of Concern, anno 2020, mese 12, variante 01). Questa variante contiene 23 sostituzioni nucleotidiche e non è filogeneticamente correlata al virus SARS-CoV-2 in circolazione nel Regno Unito al momento in cui è stata rilevata la variante. Non è chiaro come e dove abbia avuto origine SARS-CoV-2 VOC 202012/01. SARS-CoV-2 VOC 202012/01 è apparso inizialmente nel sud-est dell’Inghilterra, ma nel giro di poche settimane ha iniziato a sostituire altre linee di virus in quest’area geografica ea Londra. A partire dal 26 dicembre 2020, SARS-CoV-2 VOC 202012/01 è stato identificato da campionamenti di routine e test genomici condotti in tutto il Regno Unito. I risultati preliminari epidemiologici, di modellizzazione, filogenetici e clinici suggeriscono che SARS-CoV-2 VOC 202012/01 ha aumentato la trasmissibilità. Tuttavia, le analisi preliminari indicano anche che non vi è alcun cambiamento nella gravità della malattia (misurata in base alla durata del ricovero e alla mortalità del caso di 28 giorni), o il verificarsi di reinfezione tra i casi varianti rispetto ad altri virus SARS-CoV-2 in circolazione nel Regno Unito .1 Un’altra delle mutazioni nella variante VOC 202012/01, la delezione alla posizione 69 / 70del è stata trovata per influenzare le prestazioni di alcuni test PCR diagnostici con un gene target S. La maggior parte dei test PCR in uso in tutto il mondo utilizzerà più target e pertanto non si prevede che l’impatto della variante sulla diagnostica sia significativo. La valutazione di laboratorio non ha dimostrato alcun impatto significativo sulle prestazioni dei dispositivi a flusso laterale basati sull’antigene. Al 30 dicembre, la variante VOC-202012/01 è stata segnalata in 31 altri paesi / territori / aree in cinque delle sei regioni dell’OMS.

Il 18 dicembre le autorità nazionali del Sud Africa hanno annunciato la scoperta di una nuova variante di SARS-CoV-2 che si sta rapidamente diffondendo in tre province del Sud Africa. Il Sud Africa ha chiamato questa variante 501Y.V2, a causa di una mutazione N501Y. Sebbene SARS-CoV-2 VOC 202012/01 dal Regno Unito abbia anche la mutazione N501Y, l’analisi filogenetica ha dimostrato che 501Y.V2 dal Sud Africa sono varianti di virus diverse. Nella settimana che inizia il 16 novembre, il sequenziamento di routine delle autorità sanitarie sudafricane ha rilevato che questa nuova variante SARS-CoV-2 ha ampiamente sostituito altri virus SARS-CoV-2 circolanti nelle province del Capo orientale, del Capo occidentale e del KwaZulu-Natal. Mentre i dati genomici hanno evidenziato che la variante 501.V2 ha spostato rapidamente altri lignaggi circolanti in Sud Africa, e studi preliminari suggeriscono che la variante è associata a una carica virale più elevata, che può suggerire un potenziale per una maggiore trasmissibilità, questo, così come altri fattori che influenzano trasmissibilità, sono oggetto di ulteriori accertamenti. Inoltre, in questa fase, non ci sono prove chiare che la nuova variante sia associata a malattie più gravi o esiti peggiori. Sono necessarie ulteriori indagini per comprendere l’impatto sulla trasmissione, la gravità clinica dell’infezione, la diagnostica di laboratorio, le terapie, i vaccini o le misure preventive di salute pubblica. Al 30 dicembre, la variante 501Y.V2 del Sud Africa è stata segnalata da altri quattro paesi fino ad oggi.

Le autorità dei paesi colpiti stanno conducendo indagini epidemiologiche e virologiche per valutare ulteriormente la trasmissibilità, la gravità, il rischio di reinfezione e la risposta anticorpale a nuove varianti. Poiché una delle mutazioni (N501Y) – riscontrata in entrambe le varianti SARS-CoV-2 VOC 202012/01 e 501Y.V2 – è nel dominio di legame del recettore, le autorità stanno studiando l’attività di neutralizzazione dei sieri di pazienti guariti e vaccinati contro queste varianti per determinare se c’è un impatto sulle prestazioni del vaccino. Questi studi sono in corso.

I dati genomici delle varianti SARS-CoV-2 VOC 202012/01 e 501Y.V2 sono stati condivisi dalle autorità nazionali e caricati sulla Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data (GISAID) e la sorveglianza genomica del virus continua, a livello globale.

Sono state avviate le seguenti attività:

See Also

Le autorità nazionali che hanno segnalato varianti di virus stanno effettuando un campionamento intensificato per capire con quale ampiezza circolano queste nuove varianti.
I team scientifici nazionali stanno studiando l’effetto delle mutazioni sul potenziale di reinfezione, sulla vaccinazione, sui test diagnostici, sulla gravità dell’infezione e sulla trasmissibilità.
I ricercatori e le autorità governative stanno lavorando con l’OMS e collaborano con i membri del gruppo di lavoro sull’evoluzione del virus SARS-CoV-2 dell’OMS per valutare i risultati epidemiologici, modellistici, filogenetici e di laboratorio non appena i risultati saranno disponibili.
L’OMS sta lavorando con i paesi per identificare come gli attuali sistemi di sorveglianza possono essere rafforzati o adattati per valutare le potenziali variazioni del virus attraverso la sorveglianza clinica ed epidemiologica sistematica in corso, l’istituzione di capacità di sequenziamento genetico ove possibile e fornendo accesso ai servizi di sequenziamento internazionali per inviare campioni per il sequenziamento e analisi filogenetica.
La comunicazione del rischio e le attività di coinvolgimento della comunità sono aumentate per spiegare le implicazioni per la salute pubblica delle varianti SARS-CoV-2 al pubblico e sottolineare l’importanza di mantenere misure preventive in corso per ridurre la trasmissione come indossare coperture per il viso, praticare l’igiene delle mani e l’etichetta per la tosse, distanza fisica, garantendo una buona ventilazione ed evitando luoghi affollati.

Nell’ambito della rete globale di laboratori SARS-CoV-2 dell’OMS, che ha monitorato le mutazioni del virus dall’inizio della pandemia, nel giugno 2020 è stato istituito un gruppo di lavoro specifico sull’evoluzione del virus, composto da esperti in sequenziamento, bioinformatica e in vivo e studi di laboratorio in vitro. Il Virus Evolution Working Group lavora per 1) rafforzare i meccanismi per identificare e dare la priorità alle mutazioni (potenzialmente) rilevanti; 2) identificare precocemente le mutazioni rilevanti e studiare i potenziali impatti legati alle caratteristiche virali (ad es. Virulenza, trasmissione) e all’efficacia delle contromisure disponibili e future (ad es. Diagnostica, vaccini e terapie); 3) valutare possibili strategie di mitigazione per ridurre l’impatto negativo delle mutazioni; e 4) studiare l’impatto di mutazioni specifiche, inclusi studi di varianti in vitro e in vivo controllati in laboratorio. La condivisione di sequenze genomiche complete sta facilitando analisi dettagliate da parte dei partner. Il gruppo di lavoro sta collaborando con scienziati internazionali con una vasta gamma di competenze in virologia in generale e coronavirus in particolare per comprendere meglio i risultati della ricerca e supportare ulteriori studi.

Valutazione del rischio dell’OMS
Tutti i virus, incluso SARS-CoV-2, cambiano nel tempo, la maggior parte senza un beneficio diretto per il virus in termini di aumento della sua infettività o trasmissibilità e talvolta limitando la propagazione (vedere Domande e risposte su COVID-19 e argomenti relativi alla salute). Il potenziale di mutazione del virus aumenta con la frequenza delle infezioni umane e animali. Pertanto, la riduzione della trasmissione di SARS-CoV-2 utilizzando metodi consolidati di controllo della malattia ed evitando l’introduzione alle popolazioni animali, sono aspetti critici della strategia globale per ridurre il verificarsi di mutazioni che hanno implicazioni negative per la salute pubblica.

I dati preliminari suggeriscono che il tasso di crescita e il numero effettivo di riproduzione è elevato nelle aree del Regno Unito con circolazione comunitaria della nuova variante VOC-202012/01. In Sud Africa, i dati genomici hanno evidenziato che la variante 501Y.V2 ha spostato rapidamente altri lignaggi circolanti e studi preliminari suggeriscono che la variante è associata a una carica virale più elevata, il che può suggerire un potenziale aumento della trasmissibilità; tuttavia, questo, così come altri fattori che influenzano la trasmissibilità, sono oggetto di ulteriori indagini. Sono in corso indagini epidemiologiche per comprendere l’aumento dei casi in queste comunità e il ruolo potenziale dell’aumentata trasmissibilità di queste varianti, nonché la solidità dell’attuazione delle misure di controllo. Sebbene la valutazione iniziale suggerisca che 202012/01 e 501Y.V2 non causano cambiamenti nella presentazione clinica o nella gravità, se determinano una maggiore incidenza dei casi, ciò porterebbe ad un aumento dei ricoveri e dei decessi per COVID-19. Potrebbero essere necessarie misure di salute pubblica più intense per controllare la trasmissione di queste varianti.

Sono necessarie ulteriori indagini per comprendere l’impatto di mutazioni specifiche sulle proprietà virali e l’efficacia della diagnostica, delle terapie e dei vaccini. Queste indagini sono complesse e richiedono tempo e collaborazione tra diversi gruppi di ricerca. Questi studi sono in corso.

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Anno III N°1 Gennaio 2021

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