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Variante SARS- CoV-2. Il punto di vista dell’OMS.

Variante SARS- CoV-2. Il punto di vista dell’OMS.

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La variante è stata individuata nell’ambito di un’indagine epidemiologica e virologica avviata all’inizio di dicembre 2020 a seguito di un aumento inaspettato nei casi COVID-19 nel sud-est dell’Inghilterra. 

Redazione. (Fonte: OMS)

Il 14 dicembre 2020, le autorità del Regno Unito (UK) hanno riferito all’OMS che una nuova variante SARS-CoV-2 è stata identificata tramite sequenziamento genomico virale. Questa variante è denominata SARS-CoV-2 VUI 202012/01 (Variant Under Investigation, anno 2020, mese 12, variante 01). L’analisi iniziale indica che la variante può diffondersi più facilmente tra le persone. Sono in corso indagini per determinare se questa variante è associata ad eventuali cambiamenti nella gravità dei sintomi, nella risposta anticorpale o nell’efficacia del vaccino.

Un totale di 1108 casi infetti da SARS-CoV-2 VUI 202012/01 sono stati rilevati nel Regno Unito al 13 dicembre 2020. La variante è stata individuata nell’ambito di un’indagine epidemiologica e virologica avviata all’inizio di dicembre 2020 a seguito di un aumento inaspettato nei casi COVID-19 nel sud-est dell’Inghilterra. È stato caratterizzato da un aumento di oltre tre volte del tasso di notifica dei casi di 14 giorni dalla settimana epidemiologica 41 alla settimana 50 (dal 5 ottobre al 13 dicembre 2020). In media, tra il 5 e il 10% di tutti i virus SARS-CoV-2 sono stati sequenziati di routine nel Regno Unito e il 4% nel sud-est dell’Inghilterra dall’inizio della pandemia. Dal 5 ottobre al 13 dicembre, oltre il 50% degli isolati è stato identificato come ceppo variante nel sud-est dell’Inghilterra. L’analisi retrospettiva ha tracciato la prima variante identificata nel Kent, nel sud-est dell’Inghilterra, il 20 settembre 2020, seguito da un rapido aumento della stessa variante individuata successivamente nel mese di novembre. La maggior parte dei casi di COVID-19 dai quali è stata identificata questa variante si sono verificati in persone di età inferiore a 60 anni.

La variante è definita dalla presenza di una gamma di 14 mutazioni che comportano modifiche degli aminoacidi e tre delezioni. Alcune di queste mutazioni possono influenzare la trasmissibilità del virus nell’uomo:

  • Una delle mutazioni identificate (N501Y) sta alterando un amminoacido all’interno dei sei residui chiave nel dominio di legame del recettore (RBD). Secondo il database GISAID (Global Initiative on Sharing Avian Influenza Data), questa stessa mutazione del dominio di legame del recettore (N501Y) è stata segnalata in modo indipendente in diversi paesi, inclusi il Sud Africa (n = 45) e l’Australia (n = 37). L’analisi della sequenza ha rivelato che la mutazione N501Y del virus segnalata nel Regno Unito e in Sud Africa ha avuto origine separatamente.
  • Un’altra mutazione di significato biologico, P681H, è stata trovata nel RBD.
  • Infine, è stato riscontrato che la delezione in posizione 69/70 influisce sulle prestazioni di alcuni test PCR diagnostici che utilizzano un gene target S. La maggior parte dei test PCR in tutto il mondo utilizza più target e quindi non si prevede che l’impatto della variante sulla diagnostica sia significativo.

La nuova variante VUI-202012/01 è stata identificata in diversi paesi tra cui Australia, Danimarca, Italia, Islanda e Paesi Bassi.

Rapporti preliminari del Regno Unito indicano che questa variante è più trasmissibile dei precedenti virus circolanti, con un aumento stimato della trasmissibilità compreso tra il 40% e il 70% (aggiungendo 0,4 al numero di riproduzione di base R0, portandolo in un intervallo da 1,5 a 1,7) . Sono in corso studi di laboratorio per determinare se queste varianti di virus hanno proprietà biologiche differenti o alterano l’efficacia del vaccino. Al momento non ci sono informazioni sufficienti per determinare se questa variante è associata a qualsiasi cambiamento nella gravità della malattia clinica, nella risposta anticorpale o nell’efficacia del vaccino.

Risposta della sanità pubblica

Le autorità del Regno Unito stanno conducendo indagini epidemiologiche e virologiche per valutare ulteriormente la trasmissibilità, la gravità dell’infezione, il rischio di reinfezione e la risposta anticorpale di questa nuova variante. Poiché una delle mutazioni (N501Y) è nel dominio del legame del recettore, le autorità stanno esaminando con urgenza l’attività di neutralizzazione dei sieri di pazienti guariti e vaccinati contro questa variante per determinare se vi è un impatto sulle prestazioni del vaccino.

I dati genomici di questa variante sono stati caricati su GISAID dalle autorità del Regno Unito e la sorveglianza genomica del virus continua in tutto il paese per monitorare la situazione.

Il 19 dicembre 2020, le autorità del Regno Unito hanno annunciato che le aree colpite sarebbero state soggette a restrizioni di livello 4, tra cui riunioni sociali ridotte, restrizioni di movimento più severe, richieste di lavoro da casa ove possibile e chiusura di attività commerciali non essenziali.

Valutazione del rischio dell’OMS

Tutti i virus, incluso SARS-CoV-2, cambiano nel tempo, ma la maggior parte di queste mutazioni o cambiamenti non ha un beneficio diretto per il virus o può persino essere dannoso per la sua propagazione. Sono necessarie ulteriori indagini di laboratorio per comprendere più pienamente l’impatto di una specifica mutazione sulle proprietà virali e l’efficacia della diagnostica, delle terapie e dei vaccini. Queste indagini sono complesse e richiedono tempo e collaborazione tra diversi gruppi di ricerca.

La condivisione di sequenze genomiche complete sta facilitando analisi dettagliate da parte dei partner. Il gruppo di lavoro sull’evoluzione del virus dell’OMS SARS-CoV-2 sta lavorando con i colleghi del Regno Unito per comprendere meglio i risultati disponibili e supportare ulteriori studi.

Ulteriori studi epidemiologici e di laboratorio sono rapidamente necessari per comprendere le implicazioni di questi virus in termini di presentazione clinica, diagnosi, trattamento e sviluppo di vaccini disponibili per SARS-CoV-2.

L’OMS consiglia

I risultati preliminari del Regno Unito segnalano il problema più ampio delle mutazioni del virus SARS-CoV-2 e l’OMS sottolinea l’importanza di una tempestiva condivisione delle informazioni epidemiologiche, virologiche e complete sulla sequenza del genoma con altri paesi e gruppi di ricerca, anche attraverso piattaforme open source come come GISAID e altri.

L’OMS consiglia di condurre ulteriori studi epidemiologici e virologici per comprendere le mutazioni specifiche descritte dal Regno Unito e da altri paesi per indagare ulteriormente su eventuali cambiamenti nella funzione del virus in termini di infettività e patogenicità. L’OMS consiglia a tutti i paesi di aumentare il sequenziamento di routine dei virus SARS-CoV-2, ove possibile, e la condivisione dei dati di sequenza a livello internazionale, in particolare, per segnalare se vengono trovate le stesse mutazioni preoccupanti.

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L’OMS desidera attirare l’attenzione sulla preoccupazione per la perdita di prestazioni segnalata dei test PCR che prendono di mira il gene spike (S) del virus. Si consiglia ai laboratori che utilizzano kit PCR commerciali per i quali i geni virali mirati non sono chiaramente identificati nelle istruzioni del produttore di contattare il produttore per ulteriori informazioni. Anche i laboratori che utilizzano test PCR interni che mirano al gene S del virus dovrebbero essere consapevoli di questo potenziale problema. Al fine di limitare l’impatto sulle capacità di rilevamento nei paesi, si raccomanda anche un approccio che utilizza diversi saggi in parallelo o saggi multiplex mirati a diversi geni virali per consentire il rilevamento di potenziali varianti derivanti.

Tutti i paesi devono valutare il proprio livello di trasmissione locale e applicare adeguate attività di prevenzione e controllo, compreso l’adattamento delle misure di salute pubblica e sociali secondo la guida dell’OMS.

È importante ricordare alle comunità e agli operatori sanitari i principi di base per ridurre il rischio generale di trasmissione di infezioni respiratorie acute:

  • Evitare il contatto ravvicinato con persone che soffrono di infezioni respiratorie acute;
  • Lavaggio frequente delle mani, soprattutto dopo il contatto diretto con persone malate o il loro ambiente;
  • Le persone con sintomi di infezione respiratoria acuta dovrebbero praticare l’etichetta per la tosse (mantenere le distanze, coprire la tosse e gli starnuti con fazzoletti o indumenti usa e getta e lavarsi le mani);
  • All’interno delle strutture sanitarie, migliorare la prevenzione delle infezioni standard e le pratiche di controllo negli ospedali, in particolare nei reparti di emergenza; e
  • Indossare maschere ove appropriato e garantire una buona ventilazione.

L’OMS raccomanda le misure sanitarie elencate sopra per tutti i viaggiatori, inclusi da e verso il Regno Unito. In caso di sintomi indicativi di una malattia respiratoria acuta durante o dopo il viaggio, i viaggiatori sono incoraggiati a consultare un medico e condividere la propria storia di viaggio con il proprio medico. Le autorità sanitarie dovrebbero collaborare con i settori dei viaggi, dei trasporti e del turismo per fornire ai viaggiatori informazioni per ridurre il rischio generale di infezioni respiratorie acute, tramite cliniche sanitarie di viaggio, agenzie di viaggio, operatori di trasporto e ai punti di ingresso.

In linea con il consiglio fornito dal Comitato di emergenza su COVID-19 nella sua riunione più recente, l’OMS raccomanda agli Stati parti di riesaminare regolarmente le misure applicate ai viaggi internazionali in conformità con l’articolo 43 del RSI (2005) e di continuare a fornire informazioni e motivazioni all’OMS sulle misure che interferiscono in modo significativo con il traffico internazionale. I paesi dovrebbero anche garantire che le misure che incidono sul traffico internazionale siano basate sul rischio, basate su prove, coerenti, proporzionate e limitate nel tempo.

L’OMS ha recentemente pubblicato una guida provvisoria – ” Considerazioni per l’implementazione di un approccio basato sul rischio ai viaggi internazionali nel contesto del COVID-19 “, per fornire ai paesi un approccio basato sul rischio al processo decisionale per calibrare le misure di mitigazione del rischio legate ai viaggi in il contesto dei viaggi internazionali, con l’obiettivo di ridurre l’esportazione, l’importazione e la successiva trasmissione di SARS-CoV-2 associate al viaggio, evitando al contempo interferenze non necessarie con il traffico internazionale.

L’OMS raccomanda che i paesi adottino un approccio basato sul rischio. Le autorità nazionali sono incoraggiate a pubblicare la loro metodologia di valutazione del rischio e l’elenco dei paesi di partenza a cui si applicano le restrizioni; e questi dovrebbero essere aggiornati regolarmente. In tutte le circostanze, viaggi essenziali (p. Es., Soccorritori di emergenza; fornitori di supporto tecnico per la salute pubblica; personale critico nel settore dei trasporti e della sicurezza come i marittimi; rimpatri; e trasporto merci per forniture essenziali come cibo, medicinali e carburante) identificati dai paesi dovrebbe sempre essere prioritario e facilitato.

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